Super User

Super User

Time: 9:30-11:00,  Oct 11st (Tuesday)

Venue: Room 143, New Biology Building, THU

Host: Dr. CHEN Guo-Qiang

 

Nigel Scrutton is Director of the Manchester Institute of Biotechnology (MIB) at the University of Manchester, UK. He is responsible for the strategic leadership and operational management of the institute, which comprises over 50 leading research groups (ca 500 research staff) from across all Faculties and is home to ca £100M of current grant funding and 8 spin out companies. Nigel gained his PhD (1988; as a Benefactors' Scholar) and ScD (2003) at the University of Cambridge where he was awarded the Henry Humphrey's Research Prize. At Cambridge he held a Royal Society University Research Fellowship, a Royal Commission for the Exhibition of 1851 Fellowship and college fellowships. He was appointed Professor at the University of Manchester in 2005, where he held a BBSRC Professorial Research Fellowship and was Research Dean prior to his appointment as MIB Director. He also held academic positions (1995-2005) at the University of Leicester UK prior to taking up his current position at Manchester. He currently holds an EPSRC senior fellowship.

Abstract

 I have been fascinated by the complexity and catalytic capabilities of enzymes throughout my career. My group has pursued research on the mechanisms and structures of biocatalysts - and more recently on light-responsive proteins - and integrated these studies into ambitious synthetic biology and metabolic engineering programmes (e.g. for chemicals production). My group has undertaken ambitious, wide-ranging interdisciplinary programmes in experimental enzyme biophysics and integrated these with structural and chemical biology, computational simulation and theory. Highlights have included demonstration of the unexpected importance of nuclear tunneling mechanisms in biological catalysis, discovery of new biological cofactors (e.g. prenylated flavins), structures of enzymes in complex with lead drug compounds (e.g. for Huntington's chorea/Alzheimer's disease) and mechanistic understanding of new roles for vitamin B12 and other photoreceptors in light-activated transcriptional regulation. In the fields of metabolic engineering/synthetic biology/directed evolution we have engineered organisms to biosynthesize propane gas and a wide array of monoterpenoid products. These programmes have their foundations in basic discovery science and in selected cases extend to commercial exploitation through spin out activity.

In this lecture I will highlight selected aspects of our work focused on the enzyme family termed ‘ene reductases’. This will involve a journey from basic understanding of enzyme mechanisms, taking in structural biology, quantum biology and advanced kinetic methods, through to applications in biocatalysis, and ultimately to the engineering of microbial organisms for the production of monoterpene flavours and fragrances. The lecture will also highlight infrastructure and capabilities available in the Manchester Synthetic Biology Centre (SYNBIOCHEM) that I established recently and for which I am Director.

 

   

    

星期四, 26 5月 2016 06:28

SynBioBeta Activate! China 2016

时间:6.14-6.17

地点:北京,上海,深圳

注册参会链接http://synbiobeta.com/conferences/synbiobeta-china-2016/

111

 该会议的重点是通过整合来自企业家、学术界、产业界、政策制定者、和投资者等之间的多方关系,来促进合成生物学在中国生态系统和产业化方面的发展。通过这次活动,您不仅可以与相关的行业领袖、学者、投资人、以及企业家建立一个交流切磋、合作共赢的关系网络,还可以了解到全球最新合成生物学产业的发展动向,新技术的开发及其应用等信息。

大会报告人来自不同国家(包括美国,英国和中国)的多个行业,包括生物医药和农业,重点讨论自动化工具(如CAD)的应用以及新的DNA合成方法等。

本次会议将会让以下几种合成生物学爱好者们受益匪浅:

•技术从业者

•工业和新兴创业公司

•政府机构及投资者

•高科技开发人员

•学术及科研人员

•学生和生物爱好者

通过参加这次活动,您会发现谁是率先在中国进行合成生物学产业化研究并将其商业化的领军人物,而且,您还会深入全面的了解到合成生物学的全球发展趋势,并有机会找到合作或投资的绝佳契机。

 

 

2016516日,生命学院朱听课题组与化学系刘磊课题组合作在Nature Chemistry杂志在线发表了题为 “A synthetic molecular system capable of mirror-image genetic replication and transcription”《合成镜像生物分子系统实现遗传信息复制与转录》的论文。该论文首次通过化学合成镜像聚合酶实现了中心法则中DNA的复制与转录这两个关键步骤。Nature在线新闻同步报道并评述了该研究。

原文链接:http://www.nature.com/nchem/journal/vaop/ncurrent/full/nchem.2517.html

Nature新闻链接:http://www.nature.com/news/mirror-image-enzyme-copies-looking-glass-dna-1.19918

地球上已知所有生物都具有手性均一的特征,即构成生命的蛋白质几乎均由L型氨基酸组成,而DNARNA均由D型核糖组成;迄今为止还没有证据表明反手性生命系统在进化中曾经出现过。生命学院朱听课题组与化学系刘磊课题组合作,用化学合成方法构建了基于镜像ASFV pol X聚合酶的遗传信息复制与转录系统。该研究结果表明镜像DNA的复制与转录同样遵循碱基互补配对原则,并具有良好的手性特异性。由该镜像分子系统聚合得到的镜像DNA核酶实现了与天然DNA核酶相同的自剪切功能。该研究有望被用来聚合实用反手性核酸大分子,同时也向实现构建镜像生命系统迈出了重要的一步。

朱听课题组致力于合成生物学、基因组学研究。本文第一作者为生命学院2013级硕士研究生王子谋和化学系博士后徐维亮,通讯作者为生命学院朱听研究员和化学系刘磊教授。本课题得到国家自然科学基金委、科技部、清华大学自主科研计划、清华-北大生命科学联合中心、感染性疾病诊治协同创新中心的经费支持。

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conference

May 17th, 2016

Room 101Yingshi Building, Department of Chemical Engineering

Tsinghua University, Beijing, China

Biological technology is becoming essential platform for healthcare,green industry, low carbon economy and sustainable society. Aiming at promotion of the mutual exchange and cooperation for scientific research and technology development, 2016 Tsinghua-EMBL Forum on Advanced Biological Technology (THE-FAB’2016) will be held in Tsinghua University, Beijing, China, from May 16th to 19th, 2016. THEFAB’ 2016 is jointly organized by Tsinghua University, China, and European Molecular Biology Laboratory (EMBL), Germany. Scope of THE-FAB’2016 will cover the academic research activities and technology transfer in pioneering biological technologies from biomolecules to cellular systems. This Forum will also provide an opportunity for mutual exchange of technology transformation based on basic research for both sides.

Organizers

Tsinghua University

European Molecular Biology Laboratory (EMBL)

Key Lab of Industrial Biocatalysis, Ministry of Education

Sponsor

XIN Center, Tsinghua University

Forum Chairpersons

Prof. Xin-Hui Xing Tsinghua University

Dr. Silke Schumacher EMBL

Important dates for the symposium

1) First circular: March 8th, 2016,

2) April 30th, 2016, abstract submission deadline

3) April 15th, 2016, Invitation letter (including materials for visa application if required)

4) May 1st, 2016, second circular, and the symposium program

 

AGENDA ON MAY 17TH, 2016

Place: Room 101, Yingshi Building, Tsinghua University

8:30-8:45

Opening Ceremony

Greeting from Tsinghua University

Greeting from EMBL

8:45-9:00

Group photo

9:00-9:30

Tile

Research at Tsinghua University

Chairman: Prof. Xin-Hui Xing

Speaker

Dr. Jun-Xiao Lu

Institution

Tsinghua University

9:30-10:00

Tile

EMBL: Overview and missions

 

Speaker

Dr. Silke Schumacher

 

Institution

EMBL

10:00-10:15

Coffee break

10:15-10:45

Tile

Develop Precision Technologies for

Studying 3D Cancer Genome

Chairman: Prof. Rob Meijers

Institution

Tsinghua University

10:45-11:15

Tile

Big Data in Biology: Opportunities and

Challenges

Speaker

Prof. Charles E. Cook

Institution

EMBL-EBI

11:15-11:45

Tile

CREPT, a novel oncoprotein, promotes

tumorigenesis by regulating Cyclin D1 expression

Chairman: Prof. Henning Hermjakob

Speaker

Prof. Zhi-Jie Chang

Institution

Tsinghua University

11:45-12:15

Tile

Using the Silk Road to solve a riddle in

Neurobiology

Speaker

Prof. Rob Meijers

Institution

EMBL Hamburg


12:15-14:00

Lunch

14:00-14:30

Tile

Research highlights in structural biology

using EMBL research infrastructures

Chairman:

Prof. Guo qiang, Chen

Speaker

Prof. Matthias Wilmanns

Institution

EMBL-Hamburg

14:30-15:00

Tile

Structural studies of the bacteriophage phi29

tail

Speaker

Prof. Ye Xiang

Institution

Tsinghua University

15:00-15:30

Tile

Development and Implementation of

Community Data Standards for Proteomics

Speaker

Prof. Henning Hermjakob

Institution

EMBL-EBI

15:30-16:00

Coffee break

16:00-16:30

Tile

Degradation of non-enzymatic Tau protein

Chairman: Prof. Ye Xiang

Speaker

Prof. Yan-Mei Li

Institution

Tsinghua University

16:30-17:00

Tile

Halomonas. app, Transforming the Chemical

Industry to Biotechnology

Speaker

Prof. Geogre Guo-Qiang Chen

Institution

Tsinghua University

17:00-17:30

Tile

Integrative Biotechnology for Bioeconomy

Era

Speaker

Prof. Xin-Hui Xing

Institution

Tsinghua University

17:30-17:50

Closing remarks

Prof. Xin-Hui Xing, Tsinghua University

Dr. Silke Schumacher, EMBL

18:30-20:30

Dinner

(Quanjude Roast Duck Restaurant)

Note: 25min Presentation + 5min Q&A

 

Contact information

Dr. Nan Su

Department of Chemical Engineering,

Tsinghua University, Beijing 100084, PRC.

Tel: +86-10-6277-3004 -806

Cell phone number: +86-18610372509

Fax: +86-10-6277-0304

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Dr. Shanshan Du

Department of Chemical Engineering,

Tsinghua University, Beijing 100084, PRC.

Tel: +86-10-6277-3004 -806

Cell phone number: +86-13011090989

Fax: +86-10-6277-0304

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Curriculum Vitae of Speakers:

ZhiJie Chang (Tsinghua Univ)

George Guo-Qiang Chen (Tsinghua Univ)

XinHui Xing((Tsinghua Univ)

Ye Xiang(Tsinghua Univ)  

YanMei Li(Tsinghua Univ)

Qi Jiang(Tsinghua Univ)

Jun Ma (Tsinghua Univ)

Xiao Jun Lu(Tsinghua Univ)

Matthias Wilmanns(EMBL)

Rob Meijers(EMBL)

Henning HermjakobEMBL-EBI

Jürgen Bauer (EMBLEM

Charles E. Cook (EMBL)

Plamena Markova, LL.M(EMBL))

Dr. Silke Schumacher(EMBL)

 

清华附中生物竞赛班高一的十几位同学表示对合成生物学有兴趣,希望到中心的PI实验室学习。同学们选择了感兴趣的实验室。

中心相关的PI实验室在尽量培养同学们的兴趣的基础上给予更多的知识和帮助。同学们在新的环境下经过老师的辅导都有很大的进步。

老师们希望通过大家努力关照好这几位同学,他们都将是我们生命科学的的接班人,继承者。

清华大学鲁志课题组(RNA生物信息学实验室)招聘博士后

        本实验室专注于癌症和植物逆境胁迫相关研究,通过基因组学、生物信息学和遗传学方法发现癌症以及植物胁迫信号转导过程中的新型标记物,特别是新型的长链非编码RNA。我们通过最新一代的大规模测序技术和生物信息学分析,发现了很多重要的新型非编码基因,现在需要增加癌症和植物方面基础较好的成员加入我们进行更深入的研究,该人才可以是偏计算分析的计算背景人才,也可以是偏遗传学实验的湿实验人才。

聘条件

1. 生物信息算背景博士后(1-2名)

A 在生物信息、生物算、大数据挖掘等方面有特经验

B 较强独立从事课题研究的能力,并以第一作者身份在国际杂志上表影响因子超4分的研究文。

有植物或者癌症研究经验先。

2. 遗传学湿实验背景博士后(1-2名)

A 遗传学方面有系的知训练基因或非编码RNA的功能及其生物控具有趣。熟悉相关分子实验实验(如RNA i 等)。

B 较强独立从事课题研究的能力,并以第一作者身份在国际杂志上表影响因子超4分的研究文。

有植物或者癌症研究经验先。

位待遇:

清华大学博士后的标准福利待遇。优秀博士后可申请清华大学-北京大学生命科学联合中心“postdoctoral fellowship program”,提供具有国际竞争力的待遇和科研资助。

聘者将本人简历以及可以开始工作的时间过电至:该Email地址已收到反垃圾邮件插件保护。要显示它您需要在浏览器中启用JavaScript。

email题请标聘生物信息博士后或者聘湿实验博士后,并注明招聘信息来源,谢谢

时间: 10:00-12:00, April 6th (Wednesday)

地点: Room 1-312, FIT building

报告人: Mattew W. Chang

 Reprogramming

   

    46日,应清华信息国家实验室、清华大学合成与系统生物学研究中心研究员谢震的邀请,新加坡国立大学杨潞龄医学院以及临床、技术创新合成生物学中心的Matthew W. Chang 在清华大学FIT1-312做了题为“为了建成微生物自主生产工厂和疗法而进行的生物功能重编程”的学术报告。Chang教授首先介绍了由他牵头成立的新加坡国立大学临床、技术创新合成生物学中心的基本情况。接下来Chang教授从治疗性细胞、工程改造细胞工厂、基于细胞或非细胞依赖的生物传感器等三个方向讲述了团队的近期研究成果。本次报告展示了合成生物学在生物制造、医药等领域的应用前景,引起了在场师生的广泛兴趣。

Reprogramming biological functionalities for au-tonomous microbial factories and therapeutics

 

 

时间: 10:00-12:00, April 6th (Wednesday)

地点: Room 1-312, FIT building

报告人: Mattew W. Chang

 

Reprogramming

 

    46日,应清华信息国家实验室、清华大学合成与系统生物学研究中心研究员谢震的邀请,新加坡国立大学杨潞龄医学院以及临床、技术创新合成生物学中心的Matthew W. Chang 在清华大学FIT1-312做了题为“为了建成微生物自主生产工厂和疗法而进行的生物功能重编程”的学术报告。Chang教授首先介绍了由他牵头成立的新加坡国立大学临床、技术创新合成生物学中心的基本情况。接下来Chang教授从治疗性细胞、工程改造细胞工厂、基于细胞或非细胞依赖的生物传感器等三个方向讲述了团队的近期研究成果。本次报告展示了合成生物学在生物制造、医药等领域的应用前景,引起了在场师生的广泛兴趣。

 

 

12月10日“合成生物学定量模型与设计”研讨会在清华大学信息技术大楼举行。

研讨会现场。

本次研讨会是国内首个以定量合成生物学为主题的会议,涵盖了我国从事相关研究的主要团队,旨在加强十三五期间该领域的交流与协作。会议的召开对推进清华大学十三五合成生物学基础研究、促进清华与国内相关科研院所的深度协作,具有重要意义。

会上,与会学者针对人造生命体系的代谢网络、调控网络、基因线路、蛋白质线路定量模型与理性设计,交流了最新进展;对该领域目前存在的科学挑战与机遇,对如何更好地应用系统生物学、化学工程、自动控制等学科的基础理论设计人造生命体系,对如何更好地结合国家战略需求开展合成生物学基础研究,支撑合成生物学医农工重要应用进行了深入讨论。

研讨会由清华大学、中国科技大学共同主办,来自清华大学“合成与系统生物学研究中心”组成单位化工系、信息国家实验室、自动化系、生命学院的8位教师,以及北京大学、上海交通大学、香港大学、华南理工大学、中科院天津工业生物技术研究所、上海生命科学研究院、北京微生物所、北京计算科学研究中心、深圳先进技术研究院等11个科研院所的30多名学者参加。

清华大学化工系长江学者、973首席科学家林章凛教授和中国科技大学生科院杰出青年获得者刘海燕教授共同主持研讨会。

12月10日“合成生物学定量模型与设计”研讨会在清华大学信息技术大楼举行。

研讨会现场。

本次研讨会是国内首个以定量合成生物学为主题的会议,涵盖了我国从事相关研究的主要团队,旨在加强十三五期间该领域的交流与协作。会议的召开对推进清华大学十三五合成生物学基础研究、促进清华与国内相关科研院所的深度协作,具有重要意义。

会上,与会学者针对人造生命体系的代谢网络、调控网络、基因线路、蛋白质线路定量模型与理性设计,交流了最新进展;对该领域目前存在的科学挑战与机遇,对如何更好地应用系统生物学、化学工程、自动控制等学科的基础理论设计人造生命体系,对如何更好地结合国家战略需求开展合成生物学基础研究,支撑合成生物学医农工重要应用进行了深入讨论。

研讨会由清华大学、中国科技大学共同主办,来自清华大学“合成与系统生物学研究中心”组成单位化工系、信息国家实验室、自动化系、生命学院的8位教师,以及北京大学、上海交通大学、香港大学、华南理工大学、中科院天津工业生物技术研究所、上海生命科学研究院、北京微生物所、北京计算科学研究中心、深圳先进技术研究院等11个科研院所的30多名学者参加。

清华大学化工系长江学者、973首席科学家林章凛教授和中国科技大学生科院杰出青年获得者刘海燕教授共同主持研讨会。

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