龚海鹏

清华大学 生命学院

副教授，博士生导师

教育工作经历

1993-1997 清华大学生物科学与技术系学士  

1997-2000   清华大学生物科学与技术系硕士

2000-2006   约翰霍普金斯大学分子生物物理学博士

2006-2007   约翰霍普金斯大学分子生物物理学博士后

2007-2009   芝加哥大学生物化学和分子生物学博士后

2009-2014   清华大学生命学院助理教授

2015-至今   清华大学生命学院副教授

研究方向

1. 蛋白质结构预测与建模
2. 蛋白质设计、结构生成、及序列优化的计算方法研究
3. 蛋白质结构动态和功能计算与预测

代表性论文

1. Yuyang Zhang^#, Yuhang Liu^#, Zinnia Ma^#, Min Li, Chunfu Xu*, and Haipeng Gong*, “Improving diffusion-based protein backbone generation with global-geometry-aware latent encoding”, Nature Machine Intelligence, 7： 1104–1118, 2025.
2. Tianyu Mi^#, Nan Xiao, and Haipeng Gong*, “GDFold2: A fast and parallelizable protein folding environment with freely defined objective functions”, Protein Science, 34(2): e70041, 2025.
3. Yinghui Chen^#, Yunxin Xu^#, Di Liu, Yaoguang Xing, and Haipeng Gong*, “An end-to-end framework for the prediction of protein structure and fitness from single sequence”, Nature Communications, 15: 7400, 2024.
4. Yunxin Xu^#, Di Liu, and Haipeng Gong*, “Improving the prediction of protein stability changes upon mutations by geometric learning and a pre-training strategy”, Nature Computational Science, 4: 840–850, 2024.
5. Wenzhi Mao^#, Wenze Ding, Yaoguang Xing, and Haipeng Gong*, “AmoebaContact and GDFold as a pipeline for rapid de novo protein structure prediction”, Nature Machine Intelligence, 2: 25-33, 2020.

联系方式

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Website: http://structpred.life.tsinghua.edu.cn