高军涛

 

 

高军涛

清华大学  信息国家研究中心

副研究员      

 

 

教育经历

2000.09 –2005.07  德国海德堡大学      系统生物学        博士

1997.09 –2000.07  中国科学院              生物物理学   硕士

1992.09 –1997.07  首都医科大学          生物医学工程    学士

 

工作简历

2006-01-17至2006-04-01   欧洲分子生物学实验室   访问学者

2006-04-102010-11-30  美国Stowers医学研究所  博士后

2010-12-012011-10-28  美国伊利诺伊大学  研究科学家

2012年-现在   清华大学  副研究员

 

专业优势(当前工作领域)

利用超分辨显微技术,活细胞成像,蛋白质作用网络,和组学分析技术来建立和研究细胞生物学和三维基因组学中的新方法。

曾领导(参与)过的(国家级)科研项目

1)作为项目骨干,参与国家自然科学基金委重大项目:“ 血液肿瘤的细胞异质性及其演化研究”(项目批准号:81890990, 资助金额 1679.2万元,项目执行期5年(201911-20231231日)。国家自然科学基金重大项目(课题)818909912019/01-2023/12,造血细胞异质性的形成规律及调控机制,395.2万元,在研,参加。

2作为研究骨干,参与了2018年度国家自然科学基金委集成项目:“消化道炎癌转化共性网络机制的集成研究”(项目批准号:91729301项目执行期1年(201811-20181231日),资助金额 150 万元。项目主持人:李梢。已经结题。

3)作为项目主持人,主持国家自然科学基金面上项目用新型偏振调制超分辨显微系统和生物信息方法来研究CTCF介导的基因组三维结构(编号:31671383,项目执行期4年,起止日期:201711-20201231日),资助金额62万元。项目主持人:高军涛。

4)参与了国家重点研发计划“蛋白质机器在肺组织生理病理临界转化过程中的系统生物学研究”(项目编号:2017YFA0505503)中的课题蛋白质机器动态网络的临界理论和方法研究起止日期:2017 07 月 至 2022 06 月,经费1066万元。项目主持人:陈洛南。

5)参与了清华大学结构生物学高精尖创新中心竞争性科研经费项目“光学超分辨-冷冻电镜偶联成像技术的开发及其在蛋白结构和动力学中的应用”,起止日期:2017 01 月 至 2020 12 月,经费120万元。项目编号:100300001  部门编号:997012045。项目主持人:张奇伟。

 

代表性论文

1.   Long Chen*, Xingye Chen, Xusan Yang, Chao He, Miaoyan Wang, Peng Xi, Juntao Gao*. Advances of super-resolution fluorescence polarization microscopy and its applications in life sciences. Computational and Structural Biotechnology Journal, 2020, 18: 2209-2216. 

 

2.   Jing Niu, Xu Zhang, Guipeng Li, Pixi Yan, Qing Yan, Qionghai Dai, Dayong Jin, Xiaohua Shen, Zsuzsanna Izsvak, Jichang Wang, Michael Q. Zhang, Juntao Gao*. Novel Cytogenetic Method to Image Chromatin Interactions with Sub-kilobase Resolution: Tn5-FISH. 2020, accepted by JOURNAL OF GENETICS & GENOMICS.

 

3.   Karl Zhanghao, Xingye Chen, Wenhui Liu, Meiqi Li, Yiqiong Liu, Yiming Wang, Sha Luo, Xiao Wang, Chunyan Shan, Hao Xie, Juntao Gao, Xiaowei Chen, Xiangdong Li, Yan Zhang, Qionghai Dai*, Peng Xi*. Super-resolution Imaging of the Fluorescent Dipole Assembly with Polarized Structured Illumination Microscopy. Nature Communications,   2019 , 10:4694. doi:10.1038/s41467-019-12681-w

 

4.   Long Chen, Miaoyan Wang, Xu Zhang, Michael Zhang, Yucheng Hu*, Zuoqiang Shi*, Peng Xi* and Juntao Gao*. Group-sparsity-based super-resolution dipole orientation mapping (GS-SDOM). IEEE Transactions on Medical Imaging, 2019 Apr 11. doi: 10.1109/TMI.2019.2910221.

 

5.   Ahmed Abbas, Xuan He, Jing Niu, Bin Zhou, Guangxiang Zhu, Zishan Ma, Juntao Gao, Michael Q Zhang, and Jianyang Zeng*. Integrating Hi-C and FISH data for modeling 3D organizations of chromosomes. Nature Communications, 10, doi:10.1038/s41467-019-10005-6 (2019) (Editors’ Highlights).

 

6.   Tszshan Ma, Long Chen, Maoxiang Shi, …, Michael Zhang*, Juntao Gao*. Developing novel methods to image and visualize 3D genomes, Cell Biology & Toxicology, 2018. Invited review.

 

7.   Zhenhai Du, Hui Zheng, Bo Huang, Rui Ma, Jingyi Wu, Xianglin Zhang, Jing He, Yunlong Xiang, Qiujun Wang,Yuanyuan Li, Jing Ma, Xu Zhang, Ke Zhang, Yang Wang, Michael Q. Zhang, Juntao Gao, Jesse R. Dixon, Xiaowo Wang, Jianyang Zeng & Wei Xie. Allelic reprogramming of 3D chromatin architecture during early mammalian development, Nature, 547, 232–235 (13 July 2017)

 

8.   Maoxiang Shi, Juntao Gao*, Michael Zhang*, Web3DMol: interactive protein structure visualization based on WebGL, Nucleic Acid Research, Volume 45, Issue W1, 3 July 2017, Pages W523–W527, doi: 10.1093/nar/gkx383

 

9.   Mohamed Nadhir Djekidel, Mengjie Wang, Michael Q. Zhang*, Juntao Gao*. HiC-3DViewer: a new tool to visualize Hi-C data in 3D space. Quantitative Biology, 2017, 5(2): 183–190.

 

10.  Xusan Yang, Karl Zhanghao, Hening Wang, Yujia Liu, Fan Wang, Xu Zhang, Kebin Shi, Juntao Gao*, Dayong Jin*, and Peng Xi*, Versatile Application of Fluorescent Quantum Dot Labels in Superresolution Fluorescence Microscopy. ACS Photonics, 2016, 3(9), pp 1611–1618, DOI: 10.1021/acsphotonics.6b00178.

 

11.  Karl Zhanghao, Long Chen, …, Juntao Gao*, Peng Xi*. Super-resolution Dipole Orientation Mapping with Polarization Demodulation. Light: Science & Applications, 2016, 5, e16166; doi: 10.1038/lsa.2016.166 本工作被《Nature Methods》作为Research Highlights进行了报道。

 

12.  Yang Wang, Yanjian Li, Juntao Gao* and Michael Q. Zhang*. A novel method to identify topological domains using Hi-C data. Quantitative Biology. 2015, DOI 10.1007/s40484-015-0047-9

 

13.  Mingjing Gao, Zhen Zhao, Pengyu Lv, YuFang Li, Juntao Gao*, Michael Zhang*, Baolu Zhao. Quantitative combination of natural anti-oxidants prevents metabolic syndrome by reducing oxidative stress. Redox Biology. 2015,6:206–217

 

14.  Juntao Gao Guimerà Roger, Li Hua, Pinto Ines, Marta Sales-Pardo, Wai Stephanie C, Rubinstein Boris, Li Rong (2011) Modular coherence of protein dynamics in yeast cell polarity system. Proc. Nat. Acad. Sci. April 18, 2011, doi: 10.1073/pnas.1017567108

 

15.  Murmann Andrea, Juntao Gao, Encinosa Marrisa, Mathieu Gautier, Peter Marcus, Eils Roland, Lichter Peter, Rowley Janet D. (2005) Local gene density predicts the spatial position of genetic loci in the interphase nucleus. Experimental Cell Research 311: 14-26(被引用122次)

专利情况

针对目标核酸靶标的探针的制备方法,专利号:ZL 201910197017.3。发明人:张旭,高军涛,张奇伟,申请日期:2019315日。专利权人:清华大学,授权公告日:2020109日。

一种实现超分辨偶极子取向解析的方法,专利号:201610444289.5。发明人:陈龙,张昊,杨旭三,王淼妍,张奇伟,高军涛,席鹏,申请日期:2016620日。专利权人:北京大学,授权公告日:2016127日。 

社会贡献以及所产生的经济效益

发表了近三十篇包括国际著名期刊PNASNature在内的SCI文章,被引用二百多次。 其中,作为第一作者发表的“葡萄籽中多酚类物质对氧自由基清除作用的ESR研究”一文,为国内最早研究葡萄籽提取物对自由基损伤作用的论文,对国内葡萄籽提取物企业如天 津尖峰天然产物研究开发有限公司的研发和业务发展起到了良好的指导和推动作用。

媒体报道

2017年:  

在国内,清华大学综合新闻,对本人和颉伟教授的合作工作进行报道: http://news.tsinghua.edu.cn/publish/thunews/10303/2017/20170714112306959948 210/20170714112306959948210_.html

2016年:

在国际上,世界方法学的权威学术期刊《Nature Methods》以“研究亮点”(research highlights)的形式,对本人工作进行了报道。第13卷,第11 期,第902页。  

在国内,清华大学的新闻头条,对本人和北京大学席鹏教授、澳大利亚金大勇教授的合作 的报道: http://www.tsinghua.edu.cn/publish/thunews/9649/2016/201611170909111611888 49/20161117090911161188849_.html 

在国内,科学网论文频道一周(201610 31日至 11 6)“最受关注论文”的排行 榜冠军: http://news.sciencenet.cn/htmlpaper/2016111114465655241879.shtm

 

 

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