鲁志

 

 

 

鲁志 

清华大学   生命科学学院

研究员,博士生导师

 

教育经历

2003年         获中国科学技术大学学士学位

2008年         获罗切斯特大学获得生物物理学博士学位

2008-2011年    耶鲁大学进行博士后研究工作

2011-至今       清华大学研究员

 研究方向

研究涉及生物信息学、系统生物学(基因组学)等领域,生命的信息是怎么样被编码在DNA和RNA的结构和序列中,以及它们是如何调控整个生物系统,是我们主要的研究方向。我们致力于应用已有的分析手段和开发新的算法,去发现和诠释新的非编码RNA基因的结构和功能;运用高通量测序技术在基因组层面上去挖掘关于结构、调控等方面的新知识。最终,我们希望把科研成果运用到人类疾病的研究和治疗。实验室的科研项目主要包括基因组中新型非编码RNA基因的发掘和功能研究、RNA结构预测算法的开发和优化、应用机器学习和数据挖掘等手段分析高通量数据、通过高通量数据研究不同物种中的基因调控网络。

 

所获荣誉

 

教育部“新世纪人才计划”获得者, 清华大学“学术新人奖”获得者

 

代表论文

Hu L, Di C, Kai MX, Yang YC, Li Y, Qiu YJ, Hu XH, Yip KY, Zhang MQ, Lu ZJ. A common set of distinct features that characterize noncoding RNAs across multiple species. Nucleic Acids Research. 2015, 43: 104-114.

Yang YC, Di C, Hu BQ, Zhou MF, Liu YF, Song NX, Li Y, Umetsu J, Lu ZJ. CLIPdb: a CLIP-seq database for protein-RNA interactions. BMC Genomics. 2015, 16:51. (*contributed equally)

 

Di C, Yuan JP, Wu Y, Li JR, Lin HX, Hu L, Zhang T, Qi YJ, Gerstein MB, Guo Y, Lu ZJ. Characterization of Stress-responsive lncRNAs in Arabidopsis thaliana by Integrating Expression, Epigenetic and Structural Features. The Plant Journal. 2014, 80:848–861.

 

Gerstein MB, Rozowsky J, Yan KK,  …,  Lu ZJ,  …, Gingeras T, Waterston R Comparative Analysis of the Transcriptome across Distant Species. Nature. 2014, 512:445-448.

 

Lu ZJ, Yip KY, Wang G, Shou C, Hillier LW, et al. Predicting and characterizing non-coding RNA in C. elegans by integrating conservation, secondary structure and high-throughput sequencing and array data. Genome Research. 2011, 21: 276-2857. (*contributed equally) [modENCODE special issue – Cover Story]

 

联系方式

 

清华大学生命科学学院

北京100084,中国

电话:+86-10-62789217

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